系统软件由医学影像的专业团队和算法工程师倾力打造，界面友好，功能强大，符合专业人员的操作习惯。软件包含多项自主知识产权的图像处理和优化算法，支持多种图像滤波，校准和处理功能，支持定量测量，图像拼接和多模态融合功能。
全自动控制，支持一键采集，无需复杂操作和频繁打开暗室。用户可以通过软件控制系统内的所有成像部件，实现自动对焦，位置调整，自动曝光，滤光片切换，激发功率调整等一系列操作。通过内置监控摄像机的实时图像和内部多个传感器的实时反馈，可以实时监控内部状态的变化，方便客户进行调整。
评价小动物活体荧光成像系统的关键要素——所选用相机的性能水平。NirVivo系列采用国际上良好的科学级相机产品，CCD制冷温度可达-90℃和InGaAs制冷温度可达-80℃，有效曝光时间可达60分钟*。基于良好的硬件配置，系统具备了很高灵敏度的生物发光及荧光成像性能。通过搭配不同的光学系统，可以实现微区成像和血管动态成像。
